第三幕:时隔多年,从裘庄活下来的吴志国找到了李宁玉,向李宁玉坦白了最终的真相,原来,当年潜伏在司令部里面,为中共地下组织服务的人除了顾晓梦,还有吴志国。顾晓梦是为了掩护上级的吴志国,才选择站出来,牺牲的,吴志国就是“老枪”。在本片中,终极反派宇宙大帝从天而降,驱使以天灾为首的恐惧兽掀起地球危机。绝境之中,蛰伏许久的巨无霸(兽形金刚)终觉醒,联合以擎天柱为首的汽车人们变形出发,一场前所未有的决战即将上演。故事的重头戏设置在世界七大奇迹之一的秘鲁马丘比丘,地球上还要什么地点是变形金刚们不能打上一架的呢?